- «Ақпараттық қауіпсіздік, математикалық және компьютерлік үлгілеу» орталығы
- «Геоақпараттық технологиялар» орталығы
- «Географиялық зерттеулер» орталығы
- «Геокеңістік экономика» зертханасы
- «Қазақстан Республикасының су қауіпсіздігі: мәселелері мен шешімдері» орталығы:
- АЙМАҚТЫҚ КЛИМАТТЫҚ ӨЗГЕРІСТЕР ЗЕРТХАНАСЫ
- ГЕОТУРИЗМ ЖӘНЕ ГЕОМОРФОЛОГИЯ ЗЕРТХАНАСЫ
- ГИДРОХИМИЯ ЖӘНЕ ЭКОЛОГИЯЛЫҚ ТОКСИКОЛОГИЯ ЗЕРТХАНАСЫ
- СУ РЕСУРСТАРЫ ЗЕРТХАНАСЫ
- ТАБИҒАТТЫ ПАЙДАЛАНУ МӘСЕЛЕРІ ЖӘНЕ ЛАНДШАФТТАНУ ЗЕРТХАНАСЫ
- ТАБИҒИ ҚАУІП-ҚАТЕРЛЕР ЗЕРТХАНАСЫ
- ТАБИҒИ-ШАРУАШЫЛЫҚ ЖҮЙЕЛЕРДІ СУМЕН ҚАМТАМАСЫЗ ЕТУ ЖӘНЕ МАТЕМАТИКАЛЫҚ МОДЕЛЬДЕУ ЗЕРТХАНА